Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itgb4A2A863 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb4A2A863 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb4A2A863 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itgb4A2A863 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb4A2A863 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Itgb4A2A863 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itgb4A2A863 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb4A2A863 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms