Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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