Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf728Q6P5C7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf728Q6P5C7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.3 ms