Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfn1Q9Z0I7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfn1Q9Z0I7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn1Q9Z0I7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn1Q9Z0I7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn1Q9Z0I7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slfn1Q9Z0I7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms