Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabbr1Q9WV18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms