Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stub1Q9WUD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stub1Q9WUD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stub1Q9WUD1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms