Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema6cQ9WTM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6cQ9WTM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms