Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp6ap1Q9R1Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp6ap1Q9R1Q9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp6ap1Q9R1Q9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms