Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a3Q9QZS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a3Q9QZS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3Q9QZS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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