Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a4Q9QZR9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a4Q9QZR9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a4Q9QZR9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a4Q9QZR9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a4Q9QZR9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a4Q9QZR9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a4Q9QZR9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a4Q9QZR9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms