Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpc3Q9QZC1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc3Q9QZC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.6 ms