Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm4Q9QXA5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm4Q9QXA5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms