Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt1Q9JMD1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms