Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SacsQ9JLC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms