Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gde1Q9JL56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gde1Q9JL56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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