Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrlQ9JJU8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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