Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Herpud1Q9JJK5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Herpud1Q9JJK5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herpud1Q9JJK5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 866.9 ms