Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ78

Pbk, Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbkQ9JJ78 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PbkQ9JJ78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PbkQ9JJ78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms