Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip1Q9JJ57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip1Q9JJ57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip1Q9JJ57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms