Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RabggtaQ9JHK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RabggtaQ9JHK4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.6 ms