Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms