Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4bQ9ES61 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4bQ9ES61 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4bQ9ES61 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms