Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim54Q9ERP3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim54Q9ERP3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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