Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Irx6Q9ER75 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irx6Q9ER75 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx6Q9ER75 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx6Q9ER75 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms