Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx12Q9ER00 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx12Q9ER00 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx12Q9ER00 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms