Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r44Q9EQ47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms