Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SgshQ9EQ08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgshQ9EQ08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms