Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp13a1Q9EPE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a1Q9EPE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a1Q9EPE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a1Q9EPE9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms