Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufs3Q9DCT2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufs3Q9DCT2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms