Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubiad1Q9DC60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubiad1Q9DC60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubiad1Q9DC60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubiad1Q9DC60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms