Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actrt1Q9D9J3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actrt1Q9D9J3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actrt1Q9D9J3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms