Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Slc52a2Q9D8F3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Slc52a2Q9D8F3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Slc52a2Q9D8F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Slc52a2Q9D8F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Slc52a2Q9D8F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Slc52a2Q9D8F3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Slc52a2Q9D8F3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slc52a2Q9D8F3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slc52a2Q9D8F3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms