Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slx4ipQ9D7Y9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx4ipQ9D7Y9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4ipQ9D7Y9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms