Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf225Q9D7D1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf225Q9D7D1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf225Q9D7D1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms