Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp19Q9D7A6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp19Q9D7A6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp19Q9D7A6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms