Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syap1Q9D5V6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syap1Q9D5V6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syap1Q9D5V6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syap1Q9D5V6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.2 ms