Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc105Q9D4K7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc105Q9D4K7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms