Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp2bpQ9D4C6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms