Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cfap53Q9D439 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms