Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam227aQ9D3V8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam227aQ9D3V8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam227aQ9D3V8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam227aQ9D3V8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam227aQ9D3V8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms