Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx29Q9D3S3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx29Q9D3S3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx29Q9D3S3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx29Q9D3S3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms