Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp5Q9D387 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp5Q9D387 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp5Q9D387 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms