Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D2Q3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D2Q3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D2Q3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D2Q3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms