Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krtap5-3Q9D226 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krtap5-3Q9D226 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krtap5-3Q9D226 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krtap5-3Q9D226 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms