Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp11Q9CZJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp11Q9CZJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Utp11Q9CZJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp11Q9CZJ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp11Q9CZJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Utp11Q9CZJ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms