Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nde1Q9CZA6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nde1Q9CZA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms