Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdhd3Q9CYW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdhd3Q9CYW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms