Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem50aQ9CXL1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem50aQ9CXL1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms