Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed5Q9CXE7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed5Q9CXE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed5Q9CXE7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms