Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp23Q9CX11 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp23Q9CX11 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp23Q9CX11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms